Ignacio Arganda-Carreras

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Coautores

Johannes SchindelinDirección de correo verificada de wisc.edu
Albert CardonaMRC LMB and University of CambridgeDirección de correo verificada de mrc-lmb.cam.ac.uk
Stephan SaalfeldHHMI Janelia Research CampusDirección de correo verificada de janelia.hhmi.org
Tobias PietzschCSBD/MPI-CBGDirección de correo verificada de mpi-cbg.de
Curtis RuedenUniversity of Wisconsin-MadisonDirección de correo verificada de wisc.edu
Mark Longair(Previously) Postdoctoral researcher, Institute of Neuroinformatics, Uni / ETH ZürichDirección de correo verificada de longair.net
Stephan PreibischHHMI Janelia Research CampusDirección de correo verificada de janelia.hhmi.org
Pavel TomancakResearch Group Leader at the Max Planck Institute of Molecular Cell Biology and Genetics in DresdenDirección de correo verificada de mpi-cbg.de
Benjamin SchmidOptical Imaging Centre ErlangenDirección de correo verificada de fau.de
Kevin EliceiriRRF Walter H. Helmerich Professor Medical Physics, Biomedical Engineering, UW-MadisonDirección de correo verificada de wisc.edu
Jean-Yves TinevezResearch engineer, Institut Pasteur, Paris, FranceDirección de correo verificada de pasteur.fr
Daniel James Whitemetrology engineer at infineonDirección de correo verificada de infineon.com
H Sebastian SeungProfessor, Princeton Neuroscience Institute and Computer Science Dept.Dirección de correo verificada de princeton.edu
Fadi DornaikaIKERBASQUE Research Foundation - Ho Chi Minh City Open UniversityDirección de correo verificada de ehu.eus
Carlos Ortiz de SolorzanoFull Professor - CIMA - Universidad de NavarraDirección de correo verificada de unav.es
Philippe AndreyResearch Director (DR2), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)Dirección de correo verificada de inrae.fr
David LeglandINRAEDirección de correo verificada de inrae.fr
Arrate Muñoz BarrutiaProfessor, Univ. Carlos III de Madrid; Instituto de Investigación Sanitaria Gregorio MarañónDirección de correo verificada de ing.uc3m.es
Carlos Oscar S. Sorzano (ORCID:000...National Center of Biotechnology (CSIC)Dirección de correo verificada de cnb.csic.es
Gorka AzkuneAssociate Professor at University of the Basque Country (UPV/EHU)Dirección de correo verificada de ehu.eus

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Ignacio Arganda-Carreras

Ikerbasque Associate Researcher at University of the Basque Country and DIPC

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Machine Learning Image Processing Computer Vision Bioimage Analysis Neuroscience


Título Ordenar por citas Ordenar por año Ordenar por título	Citado por Citado por	Año
Fiji: an open-source platform for biological-image analysis J Schindelin, I Arganda-Carreras, E Frise, V Kaynig, M Longair, T Pietzsch, ... Nature Methods 9 (7), 676–682, 2012	45543	2012
BoneJ: free and extensible bone image analysis in ImageJ M Doube, MM Kłosowski, I Arganda-Carreras, FP Cordelières, ... Bone 47 (6), 1076-1079, 2010	1963	2010
Trainable Weka Segmentation: a machine learning tool for microscopy pixel classification I Arganda-Carreras, V Kaynig, C Rueden, KW Eliceiri, J Schindelin, ... Bioinformatics 33 (15), 2424-2426, 2017	1567	2017
MorphoLibJ: integrated library and plugins for mathematical morphology with ImageJ D Legland, I Arganda-Carreras, P Andrey Bioinformatics 32 (22), 3532-3534, 2016	862	2016
TrakEM2 software for neural circuit reconstruction A Cardona, S Saalfeld, J Schindelin, I Arganda-Carreras, S Preibisch, ... PloS one 7 (6), e38011, 2012	859	2012
Serial two-photon tomography for automated ex vivo mouse brain imaging T Ragan, LR Kadiri, KU Venkataraju, K Bahlmann, J Sutin, J Taranda, ... Nature methods 9 (3), 255-258, 2012	606	2012
3D reconstruction of histological sections: Application to mammary gland tissue I Arganda‐Carreras, R Fernández‐González, A Muñoz‐Barrutia, ... Microscopy research and technique 73 (11), 1019-1029, 2010	583	2010
Consistent and elastic registration of histological sections using vector-spline regularization I Arganda-Carreras, COS Sorzano, R Marabini, JM Carazo, ... Computer Vision Approaches to Medical Image Analysis: Second International …, 2006	374	2006
Crowdsourcing the creation of image segmentation algorithms for connectomics I Arganda-Carreras, SC Turaga, DR Berger, D Cireşan, A Giusti, ... Frontiers in neuroanatomy 9, 142, 2015	334	2015
Mapping social behavior-induced brain activation at cellular resolution in the mouse Y Kim, KU Venkataraju, K Pradhan, C Mende, J Taranda, SC Turaga, ... Cell reports 10 (2), 292-305, 2015	264	2015
Vision-Based Fall Detection with Convolutional Neural Networks A Núñez-Marcos, G Azkune, I Arganda-Carreras Wireless Communications and Mobile Computing 2017, 1-16, 2017	227	2017
Deep learning on chest X-ray images to detect and evaluate pneumonia cases at the era of COVID-19 K Hammoudi, H Benhabiles, M Melkemi, F Dornaika, I Arganda-Carreras, ... Journal of medical systems 45 (7), 75, 2021	141	2021
ANHIR: automatic non-rigid histological image registration challenge J Borovec, J Kybic, I Arganda-Carreras, DV Sorokin, G Bueno, ... IEEE transactions on medical imaging 39 (10), 3042-3052, 2020	80	2020
Multicolor multiscale brain imaging with chromatic multiphoton serial microscopy L Abdeladim, KS Matho, S Clavreul, P Mahou, JM Sintes, X Solinas, ... Nature communications 10 (1), 1662, 2019	78	2019
Olfactory projectome in the zebrafish forebrain revealed by genetic single-neuron labelling N Miyasaka, I Arganda-Carreras, N Wakisaka, M Masuda, U Sümbül, ... Nature communications 5 (1), 3639, 2014	71	2014
Identifying neuronal lineages of Drosophila by sequence analysis of axon tracts A Cardona, S Saalfeld, I Arganda-Carreras, W Pereanu, J Schindelin, ... The Journal of Neuroscience 30 (22), 7538-7553, 2010	63	2010
An optimized approach to perform bone histomorphometry D Malhan, M Muelke, S Rosch, AB Schaefer, F Merboth, D Weisweiler, ... Frontiers in endocrinology 9, 666, 2018	57	2018
MitoEM dataset: Large-scale 3D mitochondria instance segmentation from EM images D Wei, Z Lin, D Franco-Barranco, N Wendt, X Liu, W Yin, X Huang, ... International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted …, 2020	55	2020
NucleusJ: an ImageJ plugin for quantifying 3D images of interphase nuclei A Poulet, I Arganda-Carreras, D Legland, AV Probst, P Andrey, C Tatout Bioinformatics 31 (7), 1144-1146, 2015	49	2015
A generic classification-based method for segmentation of nuclei in 3D images of early embryos J Gul-Mohammed, I Arganda-Carreras, P Andrey, V Galy, T Boudier BMC bioinformatics 15 (1), 1-12, 2014	45	2014

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