Alessandro Laio

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Coautores

michele parrinelloDepartment of ChemistryDirección de correo verificada de phys.chem.ethz.ch
Alex RodriguezUniversity of TriesteDirección de correo verificada de units.it
Francesco Luigi GervasioProfessor of Pharmaceutical Sciences at University of Geneva & Professor of Chemistry UCLDirección de correo verificada de unige.ch
Ursula RothlisbergerProfessor of Computational Chemistry and BiochemistryDirección de correo verificada de epfl.ch
Fabio Pietrucciassociate professor (maître de conférences, HDR), Sorbonne UniversitéDirección de correo verificada de sorbonne-universite.fr
Erio TosattiTheoretical Condensed Matter PhysicistDirección de correo verificada de sissa.it
Joost VandeVondeleDeputy Director for science, Head of Research Infrastructure Engineering, CSCS, ETH ZurichDirección de correo verificada de cscs.ch
Pilar CossioFlatiron InstituteDirección de correo verificada de flatironinstitute.org
Giovanni BussiScuola Internazionale Superiore di Studi Avanzati, Trieste, ItalyDirección de correo verificada de sissa.it
marcella iannuzziUniversity of ZurichDirección de correo verificada de chem.uzh.ch
Stefano pianaResearch Fellow, DE Shaw ResearchDirección de correo verificada de deshaw.com
Fabrizio MarinelliStaff Scientist, National Institutes of Health, USADirección de correo verificada de nih.gov
Xevi BiarnésAssociate Professor, IQS School of Engineering, Universitat Ramon LlullDirección de correo verificada de iqs.url.edu
Cristian MichelettiSISSADirección de correo verificada de sissa.it
Daniele GranataSpecialist Scientist at Molecular Modelling and Design (MMD) Department, Novo Nordisk, DenmarkDirección de correo verificada de novonordisk.com
Alessandra MagistratoResearch Director, CNR-IOM at SISSADirección de correo verificada de sissa.it

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Alessandro Laio

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molecular dynamics atomistic simulations machine learning


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Escaping free-energy minima A Laio, M Parrinello Proceedings of the national academy of sciences 99 (20), 12562-12566, 2002	5331	2002
Clustering by fast search and find of density peaks A Rodriguez, A Laio science 344 (6191), 1492-1496, 2014	4358	2014
Metadynamics: a method to simulate rare events and reconstruct the free energy in biophysics, chemistry and material science A Laio, FL Gervasio Reports on Progress in Physics 71 (12), 126601, 2008	1617	2008
Efficient exploration of reactive potential energy surfaces using Car-Parrinello molecular dynamics M Iannuzzi, A Laio, M Parrinello Physical Review Letters 90 (23), 238302, 2003	863	2003
A Hamiltonian electrostatic coupling scheme for hybrid Car–Parrinello molecular dynamics simulations A Laio, J VandeVondele, U Rothlisberger The Journal of chemical physics 116 (16), 6941-6947, 2002	757	2002
Predicting crystal structures: the Parrinello-Rahman method revisited R Martoňák, A Laio, M Parrinello Physical review letters 90 (7), 075503, 2003	705	2003
A bias-exchange approach to protein folding S Piana, A Laio The journal of physical chemistry B 111 (17), 4553-4559, 2007	591	2007
Assessing the accuracy of metadynamics A Laio, A Rodriguez-Fortea, FL Gervasio, M Ceccarelli, M Parrinello The journal of physical chemistry B 109 (14), 6714-6721, 2005	583	2005
Efficient reconstruction of complex free energy landscapes by multiple walkers metadynamics P Raiteri, A Laio, FL Gervasio, C Micheletti, M Parrinello The journal of physical chemistry B 110 (8), 3533-3539, 2006	574	2006
Amyloid β protein and Alzheimer’s disease: When computer simulations complement experimental studies J Nasica-Labouze, PH Nguyen, F Sterpone, O Berthoumieu, NV Buchete, ... Chemical reviews 115 (9), 3518-3563, 2015	573	2015
Free-energy landscape for β hairpin folding from combined parallel tempering and metadynamics G Bussi, FL Gervasio, A Laio, M Parrinello Journal of the American Chemical Society 128 (41), 13435-13441, 2006	538	2006
Equilibrium free energies from nonequilibrium metadynamics G Bussi, A Laio, M Parrinello Physical review letters 96 (9), 090601, 2006	497	2006
Promoting transparency and reproducibility in enhanced molecular simulations Nature methods 16 (8), 670-673, 2019	469	2019
Physics of iron at Earth's core conditions A Laio, S Bernard, GL Chiarotti, S Scandolo, E Tosatti Science 287 (5455), 1027-1030, 2000	397	2000
Flexible docking in solution using metadynamics FL Gervasio, A Laio, M Parrinello Journal of the American Chemical Society 127 (8), 2600-2607, 2005	320	2005
A kinetic model of trp-cage folding from multiple biased molecular dynamics simulations F Marinelli, F Pietrucci, A Laio, S Piana PLoS computational biology 5 (8), e1000452, 2009	317	2009
Using metadynamics to explore complex free-energy landscapes G Bussi, A Laio Nature Reviews Physics 2 (4), 200-212, 2020	292	2020
A recipe for the computation of the free energy barrier and the lowest free energy path of concerted reactions B Ensing, A Laio, M Parrinello, ML Klein The journal of physical chemistry B 109 (14), 6676-6687, 2005	290	2005
Anisotropy of Earth's D″ layer and stacking faults in the MgSiO₃ post-perovskite phase AR Oganov, R Martoňák, A Laio, P Raiteri, M Parrinello Nature 438 (7071), 1142-1144, 2005	273	2005
An efficient real space multigrid QM/MM electrostatic coupling T Laino, F Mohamed, A Laio, M Parrinello Journal of Chemical Theory and Computation 1 (6), 1176-1184, 2005	258	2005

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